La ciudad islámica fue conquistada por Pedro Ruiz de Azagra en 1169, que asentó sobre ella y su alfoz un señorío feudal. Entre 1284 y 1289 se incorporó definitivamente a la Corona de Aragón. Albarracín fue sede episcopal, permaneciendo unida a Segorbe durante la Edad Media.
A fines de la Edad Media tenía 99 fuegos fiscales, una tercera parte de ellos, mudéjares.
Su documentación se conserva en el Archivo Municipal de Albarracín.
Documentos medievales del concejo de Albarracín en DARA