La villa y su castillo fueron conquistados por Ramón Berenguer IV al mismo tiempo de Fraga y Lérida. Poco después se entregó a la familia Moncada, bajo cuya jurisdicción permaneció hasta época moderna. En su economía tenían gran importancia las actividades comerciales derivadas de la navegación fluvial por los ríos Ebro y Segre.
En 1495 contaba con 107 fuegos, la mitad de los cuales correspondían a musulmanes.
Su documentación se conserva en el Archivo Municipal de Mequinenza.
Documentos medievales del concejo de Mequinenza en DARA
- Marta Monjo, Sarraïns sota el domini feudal. La baronia d’Aitona al segle XV, Lérida, Universitat de Lleida, 2004.
- Francisca Vilella Vila, "El castillo de Mequinenza durante el Interregno (1410-1412). Lugar de reunión y sede parlamentaria de los urgelistas, disconformes con el parlamento de Alcañiz", en XIX Congreso de Historia de la Corona de Aragón, Zaragoza, Gobierno de Aragón, 2013, pp. 887-894.